Consiste en una incapacidad total o parcial del niño de acudir al colegio. 

En ocasiones, puede estar provocado por un miedo muy concreto, como por ejemplo un examen, ser preguntado en clase, ver a un compañero que le intimida etc, pero a veces puede deberse a un temor más general como sentirse evaluado, no sentirse a gusto con sus compañeros o miedo a hacer el ridículo. 

Cuando un niño esta pasando por alguno de estos procesos es muy frecuente que aparezcan molestias físicas como dolor abdominal, cefaleas o vómitos. Suelen aparecer por la mañana, antes de ir al colegio, y por la noche, como anticipación del día siguiente. Estos síntomas suelen mejorar el fin de semana o en periodo vacacionales. 

Normalmente estos episodios van apareciendo de forma progresiva, o de manera más brusca desencadenados por algún episodio concreto. 

La fobia escolar puede acabar en un caso de fracaso escolar y con importantes problemas emocionales en los niños que lo sufren.